Enfant, Riki Naoe s’est fermé au monde, grâce à un diagnostic de narcolepsie suite à la mort tragique de ses parents. Cependant, Riki est sauvé quand, un jour fatidique, un garçon nommé Kyousuke le recrute dans une équipe qui se fait appeler les Little Busters. Accompagnés de Masato, Kengo et Rin, ces marginaux passent leur enfance à combattre le mal et à profiter de leur jeunesse.
Les années passent, et même au lycée, les coéquipiers bien soudés restent ensemble. Kyousuke décide de relancer les Little Busters en formant une équipe de baseball car ce sera sa dernière année scolaire avec eux. Ils ont cependant un problème : il n’y a pas assez de membres ! Les rôles ont tourné, car c’est maintenant au tour de Riki de tendre la main et de recruter de nouveaux amis dans les Little Busters, tout comme Kyousuke l’avait fait une fois pour lui.
Puis, un présage fait surface : Rin trouve une étrange lettre attachée à son chat, leur assignant le devoir de découvrir le « secret de ce monde » en accomplissant des tâches spécifiques. Quel est ce secret, et pourquoi est-il caché ? C’est aux Little Busters de le découvrir !
[Écrit par MAL Rewrite]
